محققان برای توالی‌یابی نانوحفره‌ها روشی جدید را ارائه کردند
تاریخ انتشار: ۲۵ فروردین ۱۴۰۰ | کد خبر: ۳۱۵۸۴۸۰۳
محققان روشی برای توالی‌یابی نانوحفره ارائه کردند که می‌توان از آن برای شناسایی و مطالعه متیلاسیون‌های DNA استفاده کرد، پدیده‌ای که در تشخیص و پیش‌بینی رفتار میکروب‌ها و باکتری‌ها نقش مهمی دارد.
به گزارش گروه فناوری خبرگزاری دانشجو، متیلاسیون DNA باکتریایی در توالی‌های متنوعی اتفاق می‌افتد و نقش مهمی در دفاع سلولی و تنظیم ژن ایفا می‌کند.
بیشتر بخوانید:
اخباری که در وبسایت منتشر نمی‌شوند!
متیلوم‌های باکتریایی حاوی سه شکل اولیه متیلاسیون DNA هستند: N ۶-متیلادین، N ۴-متیل سیتوزین و ۵-متیل سیتوزین. توالی‌یابی بیسولفیت برای نقشه‌برداری متیلاسیون DNA در ژنوم پستانداران چندان موثر نیست.
به تازگی محققان یک روش جدید ارائه کرده‌اند که در آن از توالی‌یابی نانوحفره‌ای برای شناسایی متیلاسیون‌های مختلف استفاده می‌شود. محققان این روش را برای باکتری‌های منفرد و میکروب‌های موجود در روده استفاده کردند. در این پروژه پژوهشگران با استفاده از متیلاسیون DNA اقدام به تجزیه و تحلیل میکروبیوم با وضوح بالا، نقشه‌برداری از عناصر ژنتیکی کردند.
چرا نتایج این تحقیق جالب است؟
برای نبرد با عوامل بیماری‌زای باکتریایی: مقاومت به آنتی‌بیوتیک‌ها سلامت عمومی را به خطر می‌اندازد. برای نبرد بهتر با عوامل بیماری‌زای باکتریایی، کشف اهداف جدید دارویی مهم است. شواهد نشان می‌دهد که متیلاسیون DNA باکتری‌ها نقش مهمی در تنظیم فیزیولوژی باکتریایی مانند تشکیل بیوفیلم یا تعامل پاتوژن-میزبان دارد. این روش جدید به محققان این امکان را می‌دهد تا به‌طور موثرتری متیلاسیون DNA جدید را در پاتوژن‌ها کشف کنند.
برای درک بهتر میکروبیوم: با وجود نقش میکروبیوم در سلامت انسان، مشخصه‌یابی میکروبیوم‌ها همچنان دشوار است. برای مهار موثر قدرت درمانی میکروبیوم، درک گونه‌های خاص باکتری‌ها و سویه‌های خاص در میکروبیوم انسان بسیار مهم است. روش جدید محققان، ترکیبی از قدرت توالی‌یابی طولانی مدت و متیلاسیون DNA باکتری برای مطالعه نمونه‌های پیچیده میکروبیوم در گونه‌ها است.
با بررسی سه نوع متیلاسیون DNA در نمونه‌های مختلف، پژوهشگران دریافتند که سیگنال توالی‌یابی مبتنی بر نانوحفره ناهمگنی پیچیده‌ای را در متیلاسیون‌های یک نمونه نشان می‌دهد. برای دستیابی به این پیچیدگی و امکان استفاده از توالی‌یابی با نانوحفره برای کشف متیلاسیون، محققان یک مجموعه داده از گونه‌های باکتریایی ایجاد کردند و یک روش جدید برای شناسایی و نقشه‌برداری از سه شکل متیلاسیون DNA ارائه کردند.
منبع: خبرگزاری دانشجو
کلیدواژه: توالی یابی فناوری نانو نانوحفره توالی یابی باکتری ها روش جدید نقش مهمی
درخواست حذف خبر:
«خبربان» یک خبرخوان هوشمند و خودکار است و این خبر را به‌طور اتوماتیک از وبسایت snn.ir دریافت کرده‌است، لذا منبع این خبر، وبسایت «خبرگزاری دانشجو» بوده و سایت «خبربان» مسئولیتی در قبال محتوای آن ندارد. چنانچه درخواست حذف این خبر را دارید، کد ۳۱۵۸۴۸۰۳ را به همراه موضوع به شماره ۱۰۰۰۱۵۷۰ پیامک فرمایید. لطفاً در صورتی‌که در مورد این خبر، نظر یا سئوالی دارید، با منبع خبر (اینجا) ارتباط برقرار نمایید.
با استناد به ماده ۷۴ قانون تجارت الکترونیک مصوب ۱۳۸۲/۱۰/۱۷ مجلس شورای اسلامی و با عنایت به اینکه سایت «خبربان» مصداق بستر مبادلات الکترونیکی متنی، صوتی و تصویر است، مسئولیت نقض حقوق تصریح شده مولفان در قانون فوق از قبیل تکثیر، اجرا و توزیع و یا هر گونه محتوی خلاف قوانین کشور ایران بر عهده منبع خبر و کاربران است.
خبر بعدی:
باکتری روده گروه‌های خونی را حذف می‌کند/ تولید خون اهدایی جهانی
به گزارش خبرگزاری مهر به نقل از نیواطلس، به طور کلی در جهان کمبود ذخایر خون برای انتقال این ماده حیاتی وجود دارد که یکی از دلایل این امر افزایش جمعیت مسن با تقاضای بیشتر برای خون و فقدان اهداکنندگان است. با این وجود اگر انبوهی از ذخایر خونی هم وجود داشته باشد، به راحتی نمی توان از آن استفاده کرد.
هر گروه خونی (آ، ب یا آ ب) یا هر گروه دیگری با وجود آنتی ژن های آ و ب متصل به زنجیره های قندی (oligosaccharide) روی سطح گلبول های قرمز شناسایی می شود. سلول های خونی در گروه اُ هیچ آنتی ژنی ندارند. هنگام انتقال خون باید گروه خونی اهداکننده و دریافت کننده یکسان باشد. در غیر اینصورت سیستم ایمنی به سلول های خونی اهداشده حمله و آنها را نابود می کند. این امر واکنشی مرگبار در پی خواهد داشت.
در همین راستا محققان دانشگاه فنی دانمارک(DTU) و دانشگاه لوند سوییس از آنزیم های تولید شده توسط یک باکتری معمول در روده برای حذف کردن آنتی ژن های آ و ب از گلبول های قرمز استفاده کردند. ماهر ابوهاشم یکی از مولفان ارشد تحقیق در این باره می گوید: برای نخستین بار کوکتل های آنزیمی جدید نه تنها آنتی ژن های معرف آ و ب را حذف کردند بلکه انواع دیگری از آنتی ژن که تصور نمی شد برای ایمنی انتقال خون چالش برانگیز باشند، را نیز حذف کردند.
باکتری روده کارگشای تولید گروه خون جهانی
همانطور که گفته شد، اصطلاح گروه خونی براساس ترکیبی از آنتی ژن های موجود روی سطح گلبول های قرمز خون هر فرد تعیین می شود. منظور ابوهاشم از انواع دیگر آنتی ژن در حقیت آنتی ژن های گروه خونی کشف شده از زمان کشف چهار گروه خونی در 120 سال گذشته تاکنون است.
محققان روی باکتریومی به نام Akkermansia muciniphila تحقیق کردند که در غشای روده انسان های سالم وجود دارد. همانطور که از نام آن، muciniphila، پیداست، این باکتری عاشق موسین، جزء اصلی مخاطی است که غشای داخل روده تولید می کند. باکتری مذکور از آنزیم ها برای تجزیه موسین ها برای ایجاد منبع کربن، نیتروژن و انرژی استفاده می کند و به طور اتفاقی، علاوه بر ظاهر شدن روی گلبول های قرمز در آنتی ژن های گروه خونی در غشای پوشش مخاطی وجود دارد.
نکته مهم درباره مخاط روده این باکتری است که می تواند روی ماده مذکور زندگی کند و بیشتر اوقات آنزیم هایی دارد که ساختار قند مخاطی را می شکند.
محققان 24 آنزیم باکتریایی را روی نمونه های خون آزمایش کردند و متوجه شدند آنها در تبدیل گروه خونی آ و ب به یک خون جهانی کارآمد هستند. عملکرد آنها در مقابل آنتی ژن ب نسبت به آ بسیار تاثیرگذارتر بود. ابوهاشم در این باره می گوید: ما به تولید خون جهانی از اهداکنندگان با گروه خونی ب نزدیک هستیم. البته باید تحقیقات بیشتری برای تبدیل گروه های خونی پیچیده تر آ انجام داد. تمرکز اصلی ما اکنون این موضوع است که آیا موانع دیگری در این زمینه وجود دارد یا خیر و اینکه چگونه می توان آنزیم های بدنمان را طوری ارتقا داد تا به هدف نهایی تولید خون جهانی دست یافت.
این تحقیق در ژورنال نیچر میکروبیولوژی منتشر شده است.
کد خبر 6092973
جاده کندوان یک طرفه شد