توسعه الگوریتم رایانهای برای بررسی ژنها
تاریخ انتشار: ۵ اردیبهشت ۱۴۰۰ | کد خبر: ۳۱۶۹۹۴۴۰
دانشمندان علوم زیست شناسی "موسسه پلیتکنیک فدرال لوزان" در سوئیس الگوریتمی رایانهای ایجاد کردهاند که میتواند توالی ژنها را بدون نیاز به میکروسکوپ به یک الگوی مکانی تبدیل کند.
به گزارش ایسنا و به نقل از آی او، این الگوریتم "برش نگار"(Tomographer) نام دارد. این کلمه از واژه برشنگاری گرفته شده و به نمایش سطح مقطع یک جسم سه بعدی اشاره دارد.
بیشتر بخوانید:
اخباری که در وبسایت منتشر نمیشوند!
برشنگار
با استفاده از این روش جدید بافت ابتدا در امتداد محوری مشخص به سطح مقطع متوالی بریده میشود. سپس هر یک از آنها در زوایای مختلف برش داده میشوند. سپس سلولهای برشها جدا میشوند تا اسید ریبونوکلئیک پیام رسان(mRNA) کل آنها جمعآوری شود. هر آر.ان.ای پیام رسان مربوط به ژنی است که در سلول فعال است. اندازهگیریهای برشها به عنوان اطلاعات ورودی در الگوریتم برشنگار مورد استفاده قرار میگیرند. سپس این اطلاعات الگوهای بیان ژن مکانی را در داخل بافت بازسازی میکند.
بیان ژن
بیان ژن به بیان یک ژن گفته میشود که طی این فرایند ژن از دی.ان.ای به آر.ان.ای تبدیل شود و متعاقباً به یک توالی اسید آمینه تبدیل شود که پروتئین از آن تولید میشود. روش معمول برای نقشه برداری از ژنها در بافت، روش هیبریداسیون درجا است. این روش شامل نشانهگذاری یک ژن در یک بافت خاص با نشانگر فلورسنت است. سپس بخشها/برشها در زیر میکروسکوپ ویژهای مورد بررسی قرار میگیرد تا محققان روشن شدن ژن مذکور را مشاهده کنند.
نقشه مکانی
تصاویر متوالی هر بخش با هم ترکیب میشوند و نقشه مکانی ژن در بافت را تولید میکنند. مشکل روشهایی که در آن از هیبریداسیون درجا استفاده میشود این است که آنها نیاز به تجهیزات تخصصی دارند اما با ظهور برش نگار، این روش دیگر استفاده نخواهد شد.
یافتههای این مطالعه در مجله "Nature Biotechnology" منتشر شد.
انتهای پیام
منبع: ایسنا
درخواست حذف خبر:
«خبربان» یک خبرخوان هوشمند و خودکار است و این خبر را بهطور اتوماتیک از وبسایت www.isna.ir دریافت کردهاست، لذا منبع این خبر، وبسایت «ایسنا» بوده و سایت «خبربان» مسئولیتی در قبال محتوای آن ندارد. چنانچه درخواست حذف این خبر را دارید، کد ۳۱۶۹۹۴۴۰ را به همراه موضوع به شماره ۱۰۰۰۱۵۷۰ پیامک فرمایید. لطفاً در صورتیکه در مورد این خبر، نظر یا سئوالی دارید، با منبع خبر (اینجا) ارتباط برقرار نمایید.
با استناد به ماده ۷۴ قانون تجارت الکترونیک مصوب ۱۳۸۲/۱۰/۱۷ مجلس شورای اسلامی و با عنایت به اینکه سایت «خبربان» مصداق بستر مبادلات الکترونیکی متنی، صوتی و تصویر است، مسئولیت نقض حقوق تصریح شده مولفان در قانون فوق از قبیل تکثیر، اجرا و توزیع و یا هر گونه محتوی خلاف قوانین کشور ایران بر عهده منبع خبر و کاربران است.
خبر بعدی:
طرح جنگلداری چندمنظوره با رویکرد حفاظتی و توسعه توریسم بررسی شد
به گزارش خبرگزاری علم و فناوری آنا، محمود بیات، مجری طرح پژوهشی «تهیه طرح جنگلداری چندمنظوره با رویکرد حفاظتی، توسعه توریسم و ارزیابی اثرات جنگلکاری بر خاک و پوشش گیاهی در جنگلهای سرخ گز و گز گل کوچک شهرستانهای ورامین و پیشوا» در دانشگاه تهران گفت: جنگلهای ایرانی- تورانی جایگاه ویژهای در توسعه اقتصادی و اکولوژیکی کشور دارند و تضمینکننده بقا و پایداری آب و خاک کشور هستند.
عضو هیئتعلمی مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور به تعریف گردشگری طبیعت پرداخت و گفت: گردشگری طبیعت به نوعی از انواع جهانگردی یا گردشگری اطلاق میشود که در آن طبیعت و محیط زیست برای گردشگر مقدم بر هرچیز دیگری است. از طرفی امروزه مشخص شده است که گردشگری طبیعت مهمترین منبع کسب درآمد برای حفاظت از تنوع طبیعی محسوب میشود.
این پژوهشگر بیان کرد: جنگلهای نیمهانبوه تا تنک جنگلهای ایرانی تورانی بهدلیل آنکه بسیاری از تفرجگاههای طبیعی نظیر کوه، دره، رودخانه، آبشار، غار، دریاچه، چشمه، حیات وحش و پوشش گیاهی را در خود جای دادهاند، اگر فرایند شناسایی و ناحیهبندی گردشگری طبیعی برای آنها انجام شود، میتوان برنامهریزی بهینهای برای استفاده از آنها اعمال کرد.
وی اضافه کرد: هدف اصلی طرحهای جنگلداری در این جنگلها، بررسی موضوعات اکولوژیکی، اقتصادی و اجتماعی است و برای مدیریت صحیح این جنگلها ضرورت دارد، طرح جامع و پویای جنگلداری چندمنظوره که پاسخگوی نیروهای پیشران باشد طراحی شود. به دلیل شرایط خاص اجتماعی، اقتصادی و سیاسی جنگلهای ایرانی تورانی، آسیبهای شدیدی به این جنگلها وارد شده است.
این محقق حوزه منابع طبیعی و محیط زیست گفت: مدیریت علمی در قالب طرحهای جنگلداری در جنگلهای ایرانی تورانی در چند دهه اخیر شروع شده و طرحهای متعددی در این جنگلها اجرا شده است. برای تحقق اهداف طرحهای جنگلداری، باید جنگلداری مشارکتی و اجتماعی بهکار گرفته شود.
وی ادامه داد: هدفی که این طرح در بلند مدت دنبال میکند علاوه بر حفاظت از جنگلها، سوق دادن این جنگلها با اجرای عملیاتهای پیشبینی شده در طرح به سمت پایداری جنگل و ایجاد جنگل متراکم و انبوه است.
بیات تصریح کرد: هدف اصلی از اجرای طرحهای مدیریت منابع جنگلی و طرحهای جنگلداری چندمنظوره در استان تهران و شهرستانهای ورامین و پیشوا حفاظت و احیاء جنگلها، ارزیابی اثر جنگلکاری گز بر روی پوشش گیاهی همراه و خاک و در نهایت مشخص کردن مناطق مستعد گسترش اکوتوریسم بودهاست. این امر با تهیه نقشههای شکل زمین و تلفیق آنها با نقشههای پوشش گیاهی و تیپ خاک حاصل از کارهای میدانی و عرصهای به دست آمد.
وی تأکید کرد: اهداف این طرح بلند مدت و نیازمند اعتبار زیادی بوده و لازم است از طریق ارگانهای مرتبط، اعتبار مورد نیاز تخصیص پیدا کند.
این محقق در پایان اضافه کرد: نبود بودجه، هزینه زیاد انجام مأموریت در مناطق محروم، گرمای بیش از حد هوا، فعالیتهای تحقیقاتی از جمله دادهبرداری خام را دشوار کرده بود؛ با این وجود توانستم این طرح را به نتیجه مطلوب برسانم.
انتهای پیام/